L'article R.1234-1 du code du travail prévoit que l'indemnité de licenciement prévue par l'article L.1234-9 ne peut être inférieure à une somme calculée par année de service dans l'entreprise et tenant compte des mois de service accomplis au-delà des années pleines. le code prévoit uniquement de prendre en compte les mois pleins en cas d'année incomplète, mais ne prévoit pas de prendre en compte au prorata des jours de présence pour les mois incomplet.
Mais dans votre cas, je vous conseillerais de prendre en compte le premier mois pour lequel il manque 5 jours, la différence sera minime mais évitera au salarié de vouloir faire un recours.