Je ne comprends pas votre problème, car il me semble que vous avez déjà une référence de 39 heures sur la base annuelle.

Lorsque la période de référence correspond à l'année civile ou à toutes autres périodes de 12 mois consécutifs, la durée du travail est fixée à 1607 heures.
Si vous avez une référence de 1787 heures ou plus excatement 1790 heures annuel, cela correspond déjà à une durée de 39 heures de travail par semaine.

Ces heures donnent droit à une majoration de salaire ou à un repos compensateur  de remplacement, selon les modalités suivantes :
- Les heures supplémentaires effectuées entre 1607 heures et 1790 heures (correspondant en moyenne aux 36,37, 38, 39ème heures) sont majorées de 10% ;